上海市生物信息学学会，理事长
国际计算生物学学会中国理事会（ISCB-China ），副主席
中国人工智能学会，理事
上海市计算机学会生物信息学专业委员会，主任
ACM SIGBio China，副主席
IEEE SMC Technical Committee on Systems Biology，Co-Chair
IEEE SMC Shanghai Chapter，Chair
中国人工智能学会生物信息学与人工生命专业委员会，副主任
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, Associate Editor
IEEE SMC Magazine, Associate Editor